放牧21日目-5「NetStart」についての調査-4(NetStartについて発表した論文について)
110914 16:42〜17:
今回の「NetStart」について発表されている論文は
Neural network prediction of translation initiation sites in eukaryotes: perspectives for EST and genome analysis.
A. G. Pedersen et al., Proc. Int. Conf. Intell. Syst. Mol. Biol.,5 ,226-233(1997)
である。現段階ではabstractしか参照することが出来なかったため、
論文を参照する方法を引き続き検索する。
なお、abstract上では
・本データベースを利用してシロイヌナズナで88%、脊椎動物で85%
で、正しいAUGトリプレットを選ぶことができた
・本データベースは既存の配列情報と、今まで解析をして得た情報の2つ
を利用している。
・間違ったAUGを選んだ場合でもORFを外れるものは少なかったため、
ORFを調べる1つの指標にもなる。
と言うことが述べられている。