110915 9:00〜12:00今回、動画作成を行うNetStartは デンマーク工科大学(Technical Unversity of Denmark：DTU)の 生物学配列解析センター(Center for Biological Sequence Analysis：CBS) という機関が作成しています。ホームページの情報(About CBS項を参…

110914 16:42〜17:今回の「NetStart」について発表されている論文はNeural network prediction of translation initiation sites in eukaryotes: perspectives for EST and genome analysis.A. G. Pedersen et al., Proc. Int. Conf. Intell. Syst. Mol. Bio…

110914 16:23〜16:42「NetStart」ではジョブを実行すると以下のような形で結果が帰ってきます。 この時予測された開始コドン(ATG)のAの位置にはi(initiationのi)と表記され、そのほかのATGにはN(non^-startのN)と表記されます。 また、ドット(・)はその他の…

110914 15:52〜16:23②「NetStart」の使い方 次に、NetStartの使用法についてみていきます。NetStartのtop pageを開くと「instruction」の項が存在し、以下のような説明があります。1. Specify the input sequences The sequences intended for processing ca…

110914 14:45〜15:52①「NetStart」とは何かまず、NetStartのURLは以下のようになっております。 http://www.cbs.dtu.dk/services/NetStart/そしてページを開くと以下のようなコメントがあります。The NetStart server produces neural network predictions o…

110914 12:45〜14:40久しぶりの更新です。 本日は、以前から作成していた 「RCSB PDBを使ってタンパク質の立体構造を調べる」 をyoutubeにupする操作を行いました。手順としては ↓youtubeを開く ↓いつものidといつものpass wordでログイン ↓アップロード ↓動…