121218 16:30 こんにちは。 2週間ぶりくらいの、更新です。先週は分子生物学会で、同じRAの@tabris2012くんと、@gackelNLくん が作成した、「分生で発表されたポスター内容の相関関係グラフ」が大活躍してて、 非常に刺激を受けました☆彡☆彡はい、詳しくはこ…

121205 15:00こんにちは、2週間ぶりくらいの更新です。 前回まで、ImageJの動画作成をし、これを統合TV上にUPして・・・ とやってきました。その結果、1ヶ月も経たないうちに1000回近く閲覧していただいたみたいで。 めっちゃ嬉しいのと、注目度？に押しつぶ…

121119 11:001週間とちょっとぶりの更新です。 今日は、前回まで作成していたImageJの動画を作成し終え、 統合TVとYoutubeにUPしました。今回は、原案となる動画が存在したため、ほぼ一ヶ月(取り組み開始が121025)で終了しましたが、やはり終わるともう少し…

121108 13:30こんにちは、1週間ぶりの更新です。 先週から今週にかけて、ImageJの動画作成を行って来ました。既に、見本としての動画が存在したため、比較的作りやすかったのですが、数点 思案した点を記載させて頂きます。 (このあと副司令(本日は、京都へ…

121030こんにちは、先週に引き続きの更新です。 先週から今週にかけてImageJについて、どのような機能が存在するか、 あれこれ動かして確認をし、以下のような方針で動画を作成することを司令と話し合いました。↓アクセスする↓ImageJがどんなソフトなのか。 …

121025 11:30こんにちは、一週間ぶりの更新です。 前回の日記でGendooの動画作成が終了し無事にUploadでき (ぜひ、みてくださると幸いです。一週間で300回も閲覧いただているようで、嬉しいです)、 次はKNIMEに移ると述べたのですが、先にImageJの動画作成を…

121016 13:30121012時点でGenndoの動画作成を完了しMOVファイルにしました。 他にも作業を挟んだけれど、いやしかし時間がかかった。 もっと早く、しかも分かりやすくできたらなぁといつもながら思う次第です、はい。 しかし、それにはまだまだ修行が足りな…

121010 9:00おはようございます。 昨日は、h_ono司令にGendooの動画を観ていただきました。 そこで、指摘いただいた点を書いておこうと思います。1.動画作成はQuestion → Answer型で注意をひこう もちろん、動画を利用して何らかのシステムを紹介する場合に…

120911ご無沙汰しております。 今日は、前回いただいたgendooの動画の改定指摘箇所を修正する作業を進めました。改定を行った箇所としては以下の3点です。・Gene→から検索を行なって、結果を表示した後に、更に候補遺伝子を絞り込む際に、 絞り込む手順に吹…

120829~120830ご無沙汰しておりました。 現在の進捗を綴らせていただきます。今、取り組んでいるTV作成項目は Gendoo(Gene, Disease Features Ontology-based Overview System) です。昨日の時点で、動画の作成が一段落し、Gendooの設計者のchalklesssさんに…

120727 9:30~15:30暑い日が続きますが、ログの更新を・・・。本日も、Gendooの動画編集を行いました。 (あと残り10%くらい、来週中にはUP出来るとうれしいです!)動画編集を行うCamtasiaについて、今更ながら気になったことを1つ・・・。Camtasiaでは動画の分…

120717 16:00~19:00久しぶりの更新です。すいません。 (もう少し、アップダウンなく作業を行えるようにしていかなくては。)現在取り組んでいる動画は前回から引き続いて「Gendoo」です。 前回から動画の作成をはじめ、今日で吹き出し作成が2/3ほど終了したと…

120605 16:00~17:30ブログの更新が滞り申し訳ありませんでした。 現在の進捗について書かせて頂きます。1.現在のテーマ 統合TVの作成(Gendooについて)2.現在の進捗 Gendooの動画作成を終了し、吹き出し付けに移行しました。 説明の流れとしては↓Gendooへの行…

120425 9:00〜11:00 今回は、新しい動画としてGendooを紹介することを試みています。 使い方をひと通り学習した後、以下の様に紹介動画を作成しようと 考えています。また、Gendooが 1.NCBIが定めるGene IDや遺伝子 2.OMIMのID、疾患 3.MeSHに登録されている…

OpenOffice.org Calcを開く(保存形式は「テキストCSV(.csv)」) ↓A1にtime(mmss)、B1にtitle(説明)、C1にday(日付)と入力。 ↓C2に編集する日記の日付をYYYYMMDD(例2012年3月1日→20120301)形式で入力 ↓A2に0、B2にtitleと入力 (ただしB2は動画上で最初に表示さ…

120326 9:00~12:00前回までに作成したPubChemの紹介動画を、 統合TVにUPする作業を行いました。なお、今回動画を作成する際に、 紹介動画作成についてChalklessさんに指摘いただいたことをまとめます。1.動画を作成する際は中心となる部分から説明する 何か…

120306 9:00~12:00司令の指摘に従ってPubChem CompoundとPubChem BIoAssayの違いを明確にした形の 動画を紹介する文章を以下のように作成しました。 これから動画の撮映です。 ↓PubChemは、キーワードや物質名を入力することで、目的の化学物質や生物学的な…

120301 13:00~16:00〈背景〉 どうも、Go_with_twillです。今月もよろしくお願いします。 昨日、PubChemについての説明動画を司令とChalkless氏に確認していただいた ところ、以下のような指摘を受けました。Q;このサイトの「萌え」ポイントはどこか？ このデ…

120224 16:00~17:30 120227 09:00~18:00前回まで、PubChemの動作確認を行ってきました。これを踏まえ、以下のように動画の紹介文章を作成します。↓PubChemは化学物質の構造、、生化学的性質、生物学的実験における利用歴 についてのデータベースです。 ↓調べ…

120223 09:00~12:30 120224 09:00~16:00おはようございます。3日連続で更新です。 今日は、PubChemを調べるにあたり、chalkless氏からの金言で 「まずは、Helpとか読むのではなくて何か実行してみろ!!」 との事だったのでまずは色々操作をおこなってみること…

120222 13:00~17:304.結果の表示について PubChemで検索を行うと3つのカテゴリーにわかれた結果が表示されます。 なお、このカテゴリーとは ・substance ・compound ・BioAssay の3つです。また、表示された結果にはPubChemデータベースへのリンクが 張られ…

120221 16:30~17:30 120222 08:30~12:00 ・XLogP 水とオクタノール中での分配係数。値が大きいほど疎水性度が高い (=水とオクタノールを当量加えた溶液中にある物質を加えた時に オクタノール側に溶ける量が多いほど疎水性度は高い)ということになります。 …

120221 14:30〜16:30今日は前回、movファイル出力した HPRDの動画をyotubeにUpする操作を行いました。YouTubeであげようとした時に、動画の編集エラーが出たのですが、 それはタグの表記を半角スペースを開けることで解決しました。次回以降はPubChemの動画…

120215 18:30〜20:00今日、2回目の更新です。本日付で、HPRDの動画を上げさせて頂きました。そして動画をupする際に、以下の問題が生じました。1.複数の同じ動画をupしてしまった これはPC上で戻るボタンを押してしまった事が原因のようです。 そのため、更…

120215 16:00〜17:00今日は、togoTVにバック音声を加える方法について司令より教わりました。基本的な、動画の作成を 「統合TV司令部」の統合TV作成プロトコル に従い、終わった後の操作となります。具体的には以下のように行います。1.付加する音声を持って…

120215 10:00〜16:00昨日に続き更新です。昨日、作成したHPRDの動画を司令に見ていただいた結果。 「タンパク質を検索する方法としてのQueryだけでなく、 ファミリーから検索するBrowseとアミノ酸/塩基から検索するBlast についても説明を加えたほうがいい」…

120214 15:00〜17:00 今回から新しい動画撮影に移ります。 紹介するのはPubchemです。 アクセスはこちら。googleで「Pubchemと入れると最初に出てきます。」 http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/なお、この動画については以下のようなリクエストがありました。…

120214 10:00〜15:00happy valentine's day！今日はHPRDの動画撮影とその編集を行いました。このデータベースは名前の通り ヒトのタンパク質の情報を検索することができるものなのですが、 説明するべき項目やこのデータベースとリンクしている他のデータベ…

120130 13:00~16:30前回まで、human protein reference database(HPRD) の動作報告を行って来ました。今日は、この動画で流す文章を作成します。1. Human protein reference database(HPRD)についての説明 HPRDはヒト(Homo sapiens)のタンパク質について、 …

5.Download protein-protein interactionの情報など、このHPRDで取り上げられている 情報を一括でダウンロードすることができます。 しかし、その際にはダウンロードする人の個人情報(氏名、所属等) を記入する必要があります。6.Human proteinpedia ヒトの…