2012-01-01から1ヶ月間の記事一覧

放牧32日目-「Human Protein Reference Database」-TV上での紹介文章-

120130 13:00~16:30前回まで、human protein reference database(HPRD) の動作報告を行って来ました。今日は、この動画で流す文章を作成します。1. Human protein reference database(HPRD)についての説明 HPRDはヒト(Homo sapiens)のタンパク質について、 …

放牧31日目-「Human Protein Reference Database」操作報告-続きの続き-

5.Download protein-protein interactionの情報など、このHPRDで取り上げられている 情報を一括でダウンロードすることができます。 しかし、その際にはダウンロードする人の個人情報(氏名、所属等) を記入する必要があります。6.Human proteinpedia ヒトの…

放牧番外編-TryRubyでプログラミングの勉強-

おはようございます。今日は、統合TVではなく、プログラミングの話です。先週の金曜日に、「プログラミングを覚えたい、 しかし、何からとっつけば良いのかわからない (どこにコードを書けばいいかとか、GUIとCUIの存在/違い? などなども絶賛全くわからない…

放牧31日目-「Human Protein Reference Database」操作報告-続き-

3.Blast FASTA形式でnucleotideまたはprotein sequenceを入れることで、 本データベース内に入れたsequenceの因子があるか検索してくれます。 Blastという名の通り、本家Blastと同じように結果は配列の一致度が 高いものから順に並べてくれます。 なお、リン…

放牧31日目-「Human Protein Reference Database」操作報告

120110 9:00〜11:30 120116 9:00〜12:00あけましておめでとうございます。 新年一回目の更新です。 ことしもよろしくお願いいたします。今日はHPRDを実際に動かしてどのような結果が 得られるかを確認する操作を行いました。まず、TOP pageに移動すると左側…