放牧21日目-4「NetStart」についての調査-3(NetStartの結果の解釈)

110914 16:23〜16:42

「NetStart」ではジョブを実行すると以下のような形で結果が帰ってきます。

　この時予測された開始コドン(ATG)のAの位置にはi(initiationのi)と表記され、そのほかのATGにはN(non^-startのN)と表記されます。
また、ドット(・)はその他の塩基と対応しています。

この開始コドン予測には何らかのパラメーター
(現段階で登場せず、今後調べる予定)が関与してスコアが決定されており、
その幅は0.0〜1.0となっている。そしてスコアが0.5以上であると、開始コドンであると予測されるようになっている。

EXAMPLE OUTPUT
Translation start predictions for 1 vertebrate sequence

Name: AT2A6.1
123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890
CACGCGTCCGAAGCAAGATGGAGTCAAGTGATCGTTCAAGTCAAGCAAAAGCTTTCGACG
AGACAAAAACCGGCGTGAAAGGGCTTGTGGCTTCGGGAATCAAAGAGATTCCAGCCATGT
TCCATACACCTCCGGATACTCTAACAAGCCTGAAACAAACAGCACCA
.................i..........................................
........................................................N...
...............................................

Pos Score Pred

• • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • -

18 　0.821 Yes
117 0.034 -