放牧24日目-1「NetStart」説明に利用する配列について

111013 16:00〜17:15
111017　　9:00〜9:45

久しぶりの日記の更新です。

本日はNetStart(転写産物の開始コドン予測サイト)
を説明する際に、具体例とする配列を決定しました。

今回はCDK8のmRNA配列を利用して説明を行います。

CDK8についての説明はUniProtを参照しました。
http://www.uniprot.org/uniprot/P49336

CDK8はMediator複合体のサブユニットであり、多くのpolII依存性遺伝子の転写制御に関与するcoactivatorです。
Mediator複合体はプロモーター領域に直接結合し、基本転写因子、polIIと複合体を形成することで、Mediator複合体と相互作用する遺伝子特異的制御因子が持つ情報をpolIIへと伝える役割を果たします。

次回以降、この配列を利用し動画の説明をどのように作成していくかを
検討します。